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在海南注册跨境电商公司，选择合适的注册地点需要考虑多个因素，包括交通便利性、政策支持、人才资源、物流便利等。以下是一些可能的合适地点。
1、海口国际免税城周边区域：海口国际免税城是海南自贸港的重点项目，是发展跨境电商的重要载体，在海口国际免税城周边区域注册跨境电商公司，可以享受到政策支持和便利的物流条件。
2、海南自贸试验区其他园区：海南有多个自贸试验区园区，如海口国家高新技术产业开发区、三亚崖州湾科技城等，这些园区也都有发展跨境电商的潜力，在这些园区注册公司，同样可以享受到政策支持和相关资源。
3、交通便利的市区：如果公司需要与客户、合作伙伴面对面沟通，那么在交通便利的市区设立公司可能更为合适，海口市的交通相对便利，商业配套齐全，可以满足跨境电商公司的日常运营需求。
选择合适的注册地点需要根据公司的具体情况和需求来考虑，建议您可以先了解海南各地的政策支持和资源情况，再结合公司的实际情况进行综合考虑和选择。